Материал (кал) на кишечный дисбактериоз собирается до начала лечения антибактериальными и химиотерапевтическими препаратами. Для исследования собирается свежевыделенный кал.
За 3-4 дня до исследования отменяется прием слабительных препаратов, касторового и вазелинового масла и прекращается введение ректальных свечей. Кал, полученный после клизмы, а так же после прием бария (при рентгеновском обследовании) для исследования непригоден. До сбора анализа необходимо помочиться в унитаз, далее путем естественной дефекации в подкладное судно собираются испражнения. Подкладное судно предварительно обрабатывается любым дезинфицирующим средством, тщательно промывается проточной водой несколько раз и ополаскивается кипятком. Кал собирается в стерильный контейнер с ложечкой или другую стерильную посуду, полученную накануне в лаборатории, где будет проводиться анализ кала на дисбактериоз. Материал доставляется в течение 2-3 часов с момента сбора анализа.